FileZilla Server – öflug FTP þjónn með háþróaðri stillingu aðgerða. Hugbúnaðurinn samanstendur af miðlara sem vinnur sem kerfisþjónusta og umsókn með stuðningi við ytri aðgang sem stýrir þessari miðlara. FileZilla Server styður RTP, SFTP og FTPS samskiptareglur og veitir áreiðanlegt magn gagnaverndar vegna SSL dulkóðunar. FileZilla Server leyfir þér að takmarka notandan aðgang að þjóninum, loka niður niðurhalum frá netþjónum eða innri IP tölum, stilla samþjöppunarhlutfall sendra skráa, takmarka hámarks niðurhalshraða osfrv FileZilla Server safnar tölfræði af virkni á FTP-þjónn í rauntíma sem gerir kleift að greina notendur sem eru að hlaða niður skrám eða taka þátt í ólöglegum aðgerðum.